Où faire un test Hantavirus ? Le dépistage en laboratoire de biologie médicale

Appartenant à la famille des Hantaviridae, les hantavirus sont des virus à ARN dont il existe plusieurs espèces, chacune associée à un réservoir spécifique de rongeurs sauvages. En France métropolitaine, c'est le virus Puumala, transmis par le campagnol roussâtre, qui circule de façon endémique, principalement dans le quart Nord-Est du territoire. 

Selon Santé publique France, cette zone d'endémie s'étend progressivement vers le sud et l'ouest depuis 2017. [2] La létalité de cette souche reste faible, contrairement au virus Andes, présent en Amérique du Sud, dont la forme sévère peut être bien plus redoutable. 

Ce qui distingue particulièrement le virus Andes, c'est sa capacité, dans certains contextes de contacts étroits et prolongés, à se transmettre d'une personne à une autre — une transmission interhumaine rare parmi les hantavirus. [4,5] 

Pour en savoir plus, rendez-vous sur notre article principal : Hantavirus (Souche Andes) : Point sur l’épidémie, symptômes, transmission et diagnostic en laboratoire

La période d'incubation — c'est-à-dire le délai entre l'exposition et l'apparition des premiers symptômes — varie généralement d'une semaine à deux mois après le contact avec des déjections de rongeurs infectés. Dans le contexte d'alerte hantavirus, le COREB retient un délai de 1 à 6 semaines après exposition pour repérer un patient suspect. [1,4] 

Au début de la maladie, les signes ressemblent à ceux de nombreuses infections virales courantes. Les symptômes les plus fréquents sont : 

• Fièvre élevée, apparaissant souvent de façon assez soudaine 
• Maux de tête (céphalées), parfois intenses 
• Douleurs lombaires (dans le bas du dos) et douleurs musculaires 
• Fatigue inhabituelle, parfois intense 
• Troubles digestifs : nausées, douleurs abdominales 
• Toux ou légère gêne respiratoire dans certains cas [4]

Ces signes ne permettent pas, à eux seuls, d'affirmer qu'il s'agit d'une infection à hantavirus : d'autres pathologies peuvent présenter un tableau similaire : grippe, COVID-19, paludisme ou dengue selon les voyages et expositions, leptospirose. Si une fièvre survient dans les semaines suivant une exposition compatible, signalez-le impérativement à votre médecin pour qu'une prise en charge médicale adaptée soit envisagée. 

Pour en savoir plus, rendez-vous sur notre article principal : Les Symptômes de l'Hantavirus expliqués 

Dans la majorité des cas, l'infection à hantavirus évolue sur plusieurs jours à plusieurs semaines, avec une phase aiguë dont la durée varie selon la souche et la sévérité du tableau clinique. Une hospitalisation est parfois nécessaire, en particulier lorsque les reins ou le système cardiovasculaire sont touchés de façon marquée. 

Toute personne ayant été exposée à un environnement à risque — inhalation de poussières dans un local fermé, contact direct avec des déjections de rongeurs, activité forestière ou agricole — et qui développe de la fièvre dans les semaines suivantes doit consulter un prescripteur rapidement. 

Le diagnostic repose sur un examen clinique complet, complété par des analyses biologiques réalisées dans des laboratoires experts.

Certains patients peuvent également se voir proposer un accès au dépistage sans présenter de signes cliniques, notamment : 

• Les personnes identifiées comme contacts à haut risque dans le cadre d'un foyer épidémique 
• Les co-exposés suivis par les autorités sanitaires après une transmission documentée 

Dans ce cas, la surveillance peut être organisée sur une période pouvant aller jusqu'à 42 jours après la dernière exposition. [5] 

Si vous avez été exposé à des rongeurs ou à leurs déjections dans les semaines précédentes, signalez-le explicitement lors de votre consultation : c’est l’association entre les symptômes, le contexte d’exposition et le délai écoulé qui permet au médecin d’orienter les analyses biologiques adaptées.

La sérologie est une analyse sanguine qui recherche des anticorps — des protéines produites par votre système immunitaire en réponse à un agent infectieux. Pour les hantavirus, le Centre National de Référence (CNR) indique que la confirmation d'une infection actuelle ou récente repose sur la détection des anticorps IgM et IgG anti-hantavirus dans le sérum ou le plasma. [3] 

Les IgM (immunoglobulines M) sont les anticorps de première réponse : leur présence peut orienter vers une infection récente. Les IgG témoignent quant à eux d'un contact immunitaire plus ancien, ou peuvent accompagner une infection récente selon le moment du prélèvement. 

Une précision importante : le CNR souligne qu'un résultat IgM positif isolé peut être non spécifique. Il ne constitue donc pas, à lui seul, un diagnostic certain [3] et doit toujours être interprété en lien avec vos symptômes, votre historique d'exposition et l'ensemble de votre dossier médical. 

Complémentaire à la sérologie, la RT-PCR (Reverse Transcription Polymerase Chain Reaction) est une technique moléculaire, dont vous pouvez retrouver le fonctionnement détaillé sur notre blog, qui cible directement le matériel génétique viral — ici l'ARN du hantavirus — pour confirmer sa présence dans l'organisme. Son atout majeur réside dans sa capacité à détecter le virus très tôt, dès la phase de virémie, avant même que les anticorps soient mesurables. C'est précisément pendant cette phase de virémie précoce que la RT-PCR sur prélèvement sanguin offre les meilleures chances de confirmation. 

Selon Santé publique France, l'ARN des hantavirus peut être recherché sur des prélèvements précoces de sérum ou de plasma, [1] via un circuit spécialisé : le Centre National de Référence (CNR) des Hantavirus — laboratoire de microbiologie de référence en France, hébergé à l'Institut Pasteur — ou son laboratoire associé en Guyane. 

Dans le contexte de l'alerte 2026 liée au virus Andes (foyer du navire MV Hondius), les cas confirmés à l'échelle internationale l'ont été précisément par PCR spécifique ou séquençage — ce qui illustre la place centrale de cet outil dans le diagnostic de certitude. L'ANRS MIE rapportait au 11 mai 2026 huit cas confirmés et deux cas probables, avec trois décès. Pour en savoir plus sur ce foyer, consultez notre article dédié au virus Andes et à l'épidémie 2026 [5,6]. 

Consultez votre médecin dès aujourd’hui pour discuter de vos symptômes et envisager des analyses adaptées.

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