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RELAB – Surveillance des épidémies du moment : bronchiolite, grippe, covid-19,

— 18 septembre 2024

Le suivi des épidémies en France repose sur un réseau de surveillance qui collecte et analyse ses sources de données sur diverses maladies infectieuses, notamment les cas d’infections respiratoires aiguës et les cas de diarrhées aiguës. Cette surveillance permet d’estimer l’incidence et de suivre l’évolution des épidémies à travers le pays et ses régions.

En France, c’était la mission première de l’ex-Institut de veille sanitaire, aujourd’hui intégré à l’Agence nationale de santé publique : Santé publique France qui a aussi reçu la mission de développer la politique d’éducation et prévention pour la santé et celle de préparation de la réponse aux menaces, alertes et crises sanitaires.

Virus et épidémies sous surveillance en France (grippes, bronchiolites, covid-19, coronavirus)

En France, la surveillance des épidémies s’est considérablement développée, notamment suite à la pandémie de COVID-19. Le réseau Sentinelles, en collaboration avec Santé publique France, surveille activement les infections respiratoires aiguës (IRA), qui englobent la COVID-19, la grippe, et d’autres virus respiratoires. Cette surveillance s’appuie sur l’observation de patients présentant des IRA vus par des médecins généralistes et des pédiatres.

Cette approche globale de surveillance, qui inclut également le suivi des hépatites virales et de la grippe aviaire, s’inscrit dans une perspective « One Health », reconnaissant l’interconnexion entre la santé humaine, animale et environnementale.

Un nouveau réseau est également mis en place : le réseau RELAB. 

Le réseau Sentinelle

Le réseau Sentinelles est un réseau de recherche et de veille sanitaire en soins de premiers recours (médecine générale et pédiatrie) en France hexagonale, créé en 1984 sous la tutelle conjointe de l’Inserm et de Sorbonne Université. Il est composé de plus de 1300 médecins généralistes et pédiatres libéraux bénévoles répartis sur tout le territoire. Les principaux objectifs du réseau Sentinelles sont:

  • La constitution de grandes bases de données en médecine générale et en pédiatrie, à des fins de veille sanitaire et de recherche
  • Le développement d’outils de détection et de prévision épidémique
  • La mise en place d’études cliniques et épidémiologiques

Le réseau Sentinelles, créé en 1984, surveille activement plusieurs épidémies en France métropolitaine. Depuis mars 2020, suite à l’émergence du SARS-CoV-2, le réseau a fait évoluer sa surveillance pour suivre les infections respiratoires aiguës (IRA) qui englobent la Covid-19, la grippe et d’autres virus respiratoires comme le virus respiratoire syncytial (VRS), le rhinovirus et le métapneumovirus.

Les données collectées par les médecins Sentinelles, en complément de celles d’autres partenaires, sont intégrées à la surveillance nationale globale coordonnée par Santé publique France. Elles permettent d’estimer l’incidence, de détecter les épidémies et de suivre leur évolution au niveau national et régional. Ce dispositif de surveillance continu et réactif joue un rôle clé dans la veille sanitaire en France.

Cette surveillance s’appuie sur l’observation de patients présentant une IRA vus par un médecin généraliste ou un pédiatre du réseau. En plus des IRA, le réseau Sentinelles assure depuis de nombreuses années le suivi d’autres pathologies comme :

  • La coqueluche
  • les diarrhées aiguës
  • la varicelle
  • les oreillons.
  • IST bactérienne
  • Maladie de lyme
  • Zona

Le réseau Santé Publique France

Santé publique France est l’agence nationale de santé publique, placée sous la tutelle du ministère chargé de la santé. Elle assure une surveillance épidémiologique continue et une veille sanitaire pour identifier précocement les risques sanitaires menaçant la population. L’agence surveille de nombreuses pathologies, notamment :

  • Les infections respiratoires aiguës comme la COVID-19, la grippe et la bronchiolite, intégrées dans un dispositif de surveillance syndromique.
  • Les maladies à déclaration obligatoire, dont récemment la leptospirose.
  • Les hépatites virales B, C et Delta.
  • La diphtérie, avec une attention particulière aux cas chez les migrants et voyageurs.
  • L’influenza aviaire, dans une perspective « One Health« .
  • Les noyades, via un nouveau dispositif de surveillance déployé en 2023.

Santé publique France s’appuie sur divers outils comme le système SurSaUD pour la surveillance syndromique, le consortium Emergen pour la surveillance génomique des variants du SARS-CoV-2, et collabore avec de nombreux partenaires nationaux et internationaux pour assurer une veille sanitaire efficace.

Des maladies à déclaration obligatoire

En France, 38 maladies sont à déclaration obligatoire (MDO), dont 36 sont infectieuses et 2 non-infectieuses (mésothéliomes et saturnisme chez les enfants mineurs). La liste comprend les pathologies suivantes :

Le botulisme

La brucellose

Le charbon

Le chikungunya

Choléra

Le covid-19

La dengue

La diphtérie

L’encéphalite à tiques

Les fièvres hémorragiques africaines

L’infection invasive à méningocoque

Légionellose

Leptospirose

Listériose

Mésothéliomes

Ortho poxviroses dont la variole

Paludisme autochtone

Paludisme d’importation dans les départements d’outre-mer

La peste

La poliomyélite

La rage

La rougeole

Le saturnisme chez les enfants mineurs

La schitosomiase (bilharziose) urogénitale autochtone

Suspicion de maladie de Creutzfeldt-Jakob et autres encéphalopathies subaiguës spongiformes transmissibles humaines

Le tétanos

Toxi-infection alimentaire collective

Tuberculose (incluant la surveillance des résultats issus de traitement

Tularémie

Typhus exanthématique

West nile virus

ZIKA

Ce système vise à détecter rapidement les cas pour prévenir les épidémies et adapter les politiques de santé publique. La déclaration est effectuée par les professionnels de santé, principalement les médecins et les biologistes, qu’ils soient libéraux ou hospitaliers. Ils doivent signaler les cas suspectés ou confirmés à l’Agence régionale de santé (ARS).

Pour certaines maladies comme le VIH, l’hépatite B aiguë et la tuberculose, un système de télédéclaration (e-DO) a été mis en place pour faciliter le processus. Les données collectées sont ensuite analysées par Santé publique France pour surveiller l’évolution des maladies et orienter les actions de santé publique, tout en garantissant l’anonymat des patients.

Les nouveaux réseaux de surveillance en temps réel : le réseau RELAB

Le réseau RELAB (Réseau de Laboratoires privés) est une initiative innovante de surveillance des virus respiratoires en France, notamment le SARS-CoV-2, le virus de la grippe et la circulation active du VRS responsable de la bronchiolite.

Lancé en 2023, ce réseau est le fruit d’une collaboration entre les laboratoires de biologie médicale Biogroup et Cerballiance, et les Centres Nationaux de Référence (CNR) des Virus respiratoires. RELAB analyse quotidiennement des milliers d’échantillons biologiques et collecte des informations cliniques auprès des patients, permettant un suivi en temps réel de la propagation des virus dans toutes les régions de France et pour différentes tranches d’âge. Les données anonymisées sont transmises au CNR, qui produit un bulletin hebdomadaire d’informations, offrant ainsi une vision complète de la dynamique épidémique et permettant d’anticiper les pics d’engorgement des services d’urgences. Cette surveillance continue tout au long de l’année représente une avancée majeure dans la gestion des épidémies en France

Les réponses à vos questions

Le suivi des épidémies en France est principalement assuré par le réseau Sentinelles, en collaboration avec Santé publique France. Ce système de surveillance repose sur la collecte de données auprès de médecins généralistes et de pédiatres volontaires, qui rapportent les cas de certaines maladies observées en consultation. Les données sont ensuite analysées pour estimer l’incidence et suivre l’évolution des épidémies à l’échelle nationale et régionale.

Les taux d’incidence sont calculés à partir des données fournies par le réseau Sentinelles. Ces taux d’incidence représentent le nombre estimé de nouveaux cas pour 100 000 habitants sur une période donnée, généralement une semaine. Ces taux d’incidence sont accompagnés d’intervalles de confiance (IC 95%) qui indiquent la précision de l’estimation.

Les données sont généralement mises à jour de façon hebdomadaire. Cependant, en période de crise sanitaire ou lors de pics épidémiques, la fréquence peut être augmentée. Par exemple, le réseau RELAB, lancé en 2023, permet une analyse quotidienne des échantillons biologiques pour certains virus respiratoires.
Les principales maladies sous surveillance incluent les infections respiratoires aiguës (IRA) comme la COVID-19, la grippe et la bronchiolite, ainsi que les diarrhées aiguës, la varicelle, et plus récemment la leptospirose. D’autres maladies comme la diphtérie et les hépatites virales font également l’objet d’une surveillance étroite.
Les informations sur les épidémies en cours sont rendues publiques via plusieurs canaux. Santé publique France publie régulièrement des bulletins épidémiologiques sur son site web. Le réseau Sentinelles met également à disposition des cartes et des données actualisées sur son site. De plus, des plateformes comme Ameli.fr et d’autres sites de santé publique fournissent des informations accessibles au grand public.

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