Le diagnostic de la gonococcie repose principalement sur le test d’amplification des acides nucléiques (PRC/TAAN) réalisé sur un échantillon d’urine ou un prélèvement local. La culture bactérienne reste la méthode de référence car elle permet d’identifier la bactérie et de tester sa sensibilité aux antibiotiques. Pour les hommes symptomatiques, un examen microscopique direct (coloration de Gram) peut également être utilisé sur prélèvement urétral.