Les principales maladies sous surveillance incluent les infections respiratoires aiguës (IRA) comme la COVID-19, la grippe et la bronchiolite, ainsi que les diarrhées aiguës, la varicelle, et plus récemment la leptospirose. D’autres maladies comme la diphtérie et les hépatites virales font également l’objet d’une surveillance étroite.
